病原微生物感染是人类健康的最大威胁，传染性疾病如肝炎、艾滋病、结核病等一直严重威胁人类的生命与健康。天然免疫是机体抵抗病原微生物感染的第一道防线，但是人们对于天然免疫细胞如何敏感而特异性地识别病原体感染并诱导炎症反应以清除病原体的分子机制、病原体如何逃逸天然免疫的监控而感染机体甚至造成慢性感染的机制仍不十分清晰。针对此前沿性科学问题，中国工程院院士曹雪涛率领浙江大学免疫学研究所的研究团队，围绕着天然免疫识别与炎症反应调控机制进行了创新性研究。2013年度，系统性研究结果分别发表在Cell (IF=32)、Immunity (IF=20)，Nature Communications (IF=10)等国际著名学术期刊上。

项目组从抗病毒、抗细菌感染等多角度，发现了调控炎症和抗感染的天然免疫以及自身免疫性疾病发生的新机制。筛选到RNA病毒感染巨噬细胞后能够特异性诱导表达的膜分子——唾液酸结合性免疫球蛋白样凝集素-G（Siglec-G），其以负反馈方式抑制RNA病毒识别受体RIG-I所触发的I型干扰素产生，帮助RNA病毒逃逸机体天然免疫。证实了组蛋白甲基化转移酶Ash1l通过表观调控机制抑制炎症性细胞因子--白细胞介素6（IL-6）的产生而阻止炎症性自身免疫病的发生和发展。除了IL-6，炎性细胞因子IL-1β在天然免疫中发挥着重要的作用，其需要一类叫做炎性复合体（inflammasome）的分子复合物将它剪切成为成熟体。课题组发现了NLRP3炎性复合体活化引起NLRP3与LRRFIP2结合并促进Flightless I介导的Caspase-1活化的现象，为抗炎治疗提供了一个潜在靶点。

该项目揭示了RNA病毒如何通过其独特方式在天然免疫细胞中抑制RNA病毒识别受体功能的新型分子机制，发现了组蛋白甲基化转移酶通过表观调控机制抑制炎性自身免疫疾病的发生发展，寻找到对炎症小体激活起负向调控作用的新分子，从不同层面阐述了天然免疫与炎症调控的新型分子机制。该系列研究为了解免疫与炎症的关系、疫苗研发以及相关免疫药物研制、临床疾病的免疫诊治与判断预后等应用转化研究提供了实验基础。《中国科学报》头版、《科技日报》头版、《浙江日报》、科学网等新闻媒体都相继进行了报道。